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基因测序

chromas_DNA基因测序峰图分析查看软件 V2.6.5 下载

  • 软件大小:3.41mb
  • 更新时间:2021-06-01
  • 软件语言:英文
  • 所属分类:理科专栏
  • 软件类型:国外软件
  • 授权方式:免费版
  • 用户评分:评分
  • 下载官网:www.yx12345.com
  • 运行环境:XP,Win7,Win8,Win10
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软件介绍网友评论

您是否正想找一款第三方软件来打开来自Applied Biosystems和Amersham MegaBace DNA测序仪的色谱图文件,分析查看DNA基因测序峰图?目前这类的专业软件中比较常用的就是chromas,Chromas可以对图谱进行有效的分析,有需要的朋友试试吧。

界面预览图:

chromas_DNA基因测序峰图分析查看软件

对于现代信息学,生物信息学也是一个不可忽视的分支,基因序列信息,突变位点信息等的检测帮助我们更好地走在时代前沿,现在有很多人从事这项研究与学习。

而收到的测序报告的图谱文件一般都是SCF格式,SCF格式文件怎么打开呢?

Chromas是一个专业好用的DNA测序分析软件,使用这款软件可以方便用户对DNA的峰形图进行查看与编辑操作,软件支持ab1、scf与ztr格式的图谱文件,支持自动删除低质量序列(当质量数据可用时)或矢量序列,除此之外,软件还能根据FASTA,FASTQ,EMBL,GenBank或​​GCG格式、文本格式来导出,容易查看与编辑DNA的峰形图。

在实际使用中,Chromas软件可以查看DNA测序序列,方便好用,不需要注册。直接打开测序后的DNA图谱,用于检测基因突变,适合于遗传学研究的小伙伴。

总而言之,Chromas 是一个比较好用的分子生物学测序结果分析软件!

DNA测序图谱浏览效果截图

功能特点:

1、印色谱图,可选择缩放或适合一页。

2、纯文本格式导出序列,使用基本编号、FASTA、EMBL、GenBank 或 GCG 格式进行格式化。

3、序列以纯文本或 FASTA 格式覆盖到剪贴板,以便粘贴到其他应用程序中。

4、批量色谱文件中导出序列,并自动删除矢量序列。

5、转与补充序列与色谱图。

6、过精确匹配或最佳比对搜索序列。

7、3帧中显示翻译与序列。

8、制色谱图部分的图像以粘贴到文档或演示文稿中。

9、开来自 Applied Biosystems 与 Amersham MegaBace DNA 测序仪的色谱图文件。

10、由 ALF、Li-Cor、Visible Genetics OpenGene、Beckman CEQ 2000XL 与 CEQ 8000 与其他测序仪创建的 SCF 格式色谱图文件。

11、Genescan 基因型文件。

12、SCF 或 Applied Biosystems 格式保存。

13、可以打开ABI格式的序列文件。

14、分析测序结果。

15、abi/scf文件。

Chromas查看编辑DNA测序结果教程(文字版,仅供参考):

1、打开Chromas软件,选择File菜单打开一个序列文件,或者直接通过Open打开。

2、般测序中一个反应大概能测的长度为800左右,由于荧光染料的干扰与机器性能,测序结果在最开始与最后面时有几十个碱基不精准,下图可供参考中红框的部分。评判测序结果时可以忽略前50个与后50个碱基。

3、可以过工具栏的缩放工具,可以放大或者缩小整个视图。

4、过工具栏的Find工具,可以查找某个序列。

5、过File菜单栏的Blast Search可以直接连接在线数据库,将序列进行Blast,省去了打开NCBI等数据库随后复制序列再比对的麻烦。

6、点击OK之后出现如下界面,随后点击View report就OK了。

7、Chromas还自带序列翻译蛋白质功能,点击Options->Show Translations->All显示三条蛋白质翻译序列。这里之所以显示三条,是因为Chromas不知道你的序列翻译的起始位点,所以如果你的序列是cDNA序列,那么这个时候这三条蛋白质序列中总有一条是你需要的,这在我们做蛋白质点突变时非常有用。当然如果你的是启动子等其他序列,这个功能是多余的。

8、小伙伴们可以将序列导出,并且可以设置导出的间隔、分行、与是否显示序号,下面的设置中代表每60个碱基一行。

9、Chromas可以存储为PDF格式,在File里面选择Print 预览,随后选择PDF就OK了。

小编总结:

Chromas是一个好用的DNA测序图谱软件,你可以把它理解成是一个DNA基因测序峰图分析查看软件,它主要适用于实用的生物学人员使用,软件适用于测序的项目可以高达几百万碱基,并具有实用的基本序列编辑、序列分析、生成限制位点与片段图与搜索序列等多种功能,Chromas是您进行DNA基因测序研究的好帮手。

下载地址

chromas_DNA基因测序峰图分析查看软件 V2.6.5 下载

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